Blandingen etter koking er en trefaseblanding av olje, vann (buljong) og fast rest (oljerester). Effektiv og grundig separering av disse tre fasene er avgjørende for å oppnå høy-ren olje og tørket oljerester. Utstyrskonfigurasjonen på dette stadiet reflekterer vekten på separasjonseffektivitet.
Separasjon innebærer vanligvis to trinn. Det første trinnet er fast-væskeseparasjon, ofte ved hjelp av en skruepresse eller horisontal sentrifugalsikt. Skruepressen transporterer og komprimerer materialet via en skrueaksel, og oppnår første separasjon gjennom filtrering med en sikt. Ytelsen avhenger av skruens kompresjonsforhold og skjermens porestørrelse og styrke, noe som direkte påvirker oljeinnholdet og prosesskapasiteten til oljerester. Det andre trinnet er olje-vannseparasjon, separering av ren olje fra den pressede olje-vannblandingen. Dette trinnet involverer ofte en oljeutskiller eller en bunnfellingstank. Høyhastighets sentrifugale oljeseparatorer utnytter tetthetsforskjellen mellom olje, vann og sporfaste urenheter for å oppnå rask og kontinuerlig separasjon i et sentrifugalkraftfelt, og tilbyr høy effektivitet, men krever også betydelige investeringer og vedlikehold. Separasjonstanker er avhengige av tyngdekraften for naturlig avsetning. Selv om de er enkle å betjene, er de tidkrevende-, og renheten til den separerte oljen påvirkes betydelig av smeltepunktet. De er egnet for applikasjoner der effektiviteten ikke er kritisk. Effektiviteten til denne separasjonsprosessen bestemmer direkte vanninnholdet, urenhetsinnholdet og påfølgende raffineringsvanskeligheter for den ferdige oljen.

